De bug in de game ontstaat wanneer spelers sniper buddy Quiet meenemen in twee specifieke mi ies. Om te voorkomen dat savedata wordt aangetast raadt Konami aan om Quiet voor mi ies 29 en 42 op Mother Base achter te laten.
Het probleem komt voor op alle platforms waar de game op is uitgebracht. In een nieuwe blogpost biedt de Konami zijn excuses aan en laat weten dat er gewerkt word aan een patch die het probleem zal verhelpen.