In Siege zitten spelers in een team van vijf Rainbow Six-leden die strijden tegen een team van vijf terroristen. De teams bespreken afzonderlijk van elkaar tactieken. Er kunnen daarnaast droids gebruikt worden om het gebied te verkennen.

In de pre-alfa demo die Ubisoft toonde, waren de terroristen gesitueerd in een huis in een woonwijk met een gijzelaar. Spelers vielen vanuit een helikopter binnen om de gijzelaar te redden. Spelers vechten het uit in verschillende rondes.

Rainbow Six: Siege is een compleet nieuwe Rainbow Six-game en heeft geen verbintenis met het in 2011 onthulde Rainbow 6: Patriots. Die game zou een dynamisch singleplayerverhaal bieden over de werkelijkheid van het hedendaags terrorisme. De ontwikkeling van Patriots is inmiddels geannuleerd.