De hoofdpersoon van Burning Skies is Tom, de game introduceert daarmee een ander personage naast Nathan Hale, Joseph Capelli en James Greyson, die in eerdere titels de hoofdrol op zich namen. Het verhaal van Burning Skies speelt zich af op het moment dat de vijandelijke Chimera de Verenigde Staten aanvallen.
De touchbesturing van de PS Vita laat spelers op ieder moment, met een druk op het scherm, een bijl als wapen gebruiken. Ook kunnen zij, wanneer ze schuilen achter een muur of ander object, via de touchscreen een granaat gooien. Door de Vita te kantelen kunnen spelers over dekking heen kijken, dit kan echter ook door op de linker schouderknop van de Vita te drukken.