PES 2016 voegt een dynamisch weersysteem toe, naast een verbeterd collision-systeem en betere graphics en animaties. Voor PlayStation-consoles komt Konami ook met een Anniversary-edition die onder andere in-game valuta en een extra speler bevat.
Konami onthult ook de boxart van PES 2016, met voetballer Neymar Jr. op de voorkant. Neymar is ook een speelbaar personage in het spel.
