TimeShift is een game met een lang, lang verhaal. De game is namelijk na teleurstellende reacties grondig herzien en nu eigenlijk in een compleet ander hoesje gestoken. Nog steeds draait de game om het spelen met de tijd. Het verhaal is dat Dr. Aiden Krone een sprong in de tijd genomen, waardoor er een alternatieve realiteit is gecreëerd. Jij zult alles weer recht moeten zetten met je speciale Beta Suit, waarmee je de tijd niet alleen kunt vertragen, maar ook kunt stoppen en terugspoelen.

Het introfilmpje uit de game laat ons kennis maken met de Beta Suit en doet dit met cinematische beelden waarin we de tijd al eenmaal terug gespoeld zien worden.