Om de game te kunnen draaien hebben spelers minmaal een PC nodig met de volgende onderdelen.

- Windows Vista (SP2), Windows 7 (SP1) of Windows 8
- 2.66 gigahertz Intel Core2 Duo E6700-processor of een 3.00 GHz AMD Athlon 64 X2 6000+ 
- 2 gigabyte ram (4 GB wordt aanbevolen)
- 17 GB aan vrije hardeschijfruimte

De ondersteunde videokaarten ten tijde van de release zijn de kaarten in AMD Radeon HD-series 3870, 4000, 5000, 6000, 7000 of beter. De ondersteunde Nvidia GeForce-videokaarten komen uit de series 8600 GT, 9, 100, 200, 300, 400, 500, 600 of beter. Alleen op deze chipsets kan de game draaien. Ubisoft benadrukt dat laptopversies van deze kaarten mogelijk ook werken, maar dat die geen ondersteuning krijgen.

Verder biedt de PC-versie van AC3 ondersteuning voor zowel muis en toetsenbord als voor een controller. De Xbox 360-controller wordt daarbij aangeraden.