De hoofdpersoon uit de Assassin's Creed-serie, Desmond, gebruikt de Animus-machine om herinneringen van zijn voorvaders opnieuw te herleven. De Wii U-versie van Assassin's Creed III toont verder de informatie die de machine geeft, zoals de biografie van bepaalde personages, via het scherm dat op de Wii U-controller zit.

Ook is op dit scherm de map te zien. De touchscreen kan daarnaast gebruikt worden om wapens te selecteren en te wisselen tussen een of twee wapens. Ook kunnen spelers het apparaat inzetten voor het gebruik van Eagle Vision en kan daarbij via de accelerometer de camera worden bestuurd. Wanneer Assassin's Creed III voor Wii U lanceert, is niet bekend. De PC- Xbox 360- en PlayStation 3-versie komt op 31 oktober.