The Legend of Zelda: Four Swords Anniversary Edition maakt deel uit van de jubileumactie die Nintendo organiseert rondom de 25ste verjaardag van de Zelda-reeks. Vanaf 28 september kunnen spelers de game gratis downloaden via hun Nintendo DSi, DSi XL of 3DS. Anders dan in de originele GameCube-versie is het nu ook mogelijk om het hele spel alleen te doorlopen met een tweede Link erbij. Deze wordt dan bestuurd door de computer. Spelers kunnen tussen de twee Links wisselen door op de L- of R-knop te drukken.

Ook is het origineel uitgebreid met twee exclusieve nieuwe gebieden die elk drie levels bevatten die speciaal voor de DSi-versie zijn gemaakt. Door de nieuwe gebieden te voltooien, kunnen spelers voor elke Link speciale vaardigheden vrijspelen. Four Swords voor DSi blijft tot 20 februari 2012 beschikbaar voor hen om gratis te downloaden.