Net als de singeleplayer kent de multiplayermodus een turn-based speelstijl waarin de nadruk ligt op strategie en tactieken. Aan het begin van een deathmatch krijgen beide spelers tienduizend punten toegekend die ze naar eigen inzicht kunnen investeren in het vormen van hun eigen squads die bestaan uit zes soldaten, aliens, of combinaties van die twee. Spelers kunnen hun units uitrusten met diverse wapens, soorten bepantsering, items en meer. Na het samenstellen en uitrusten van hun squads krijgen beide spelers steeds negentig seconden de tijd om hun zet te doen.
"In de geschiedenis van de Xcom-serie hebben spelers opgetreden als de laatste hoop van de wereld tegen een buitenaardse invasie", vertelt lead designer Jack Solomon. "Met de mulitplayermodus in Xcom: Enemy Unknown kunnen gamers eindeljk ontdekken hoe het is om alien units aan te sturen en buitenaardse vernietiging te botvieren op Aarde of kunnen ze de planeet juist verdedigen met een squad van Xcom-soldaten met buitenaardse bondgenoten."