BioWare werkt aan een manier om nieuwe spelers het verhaal van de vorige twee delen te vertellen. De ontwikkelaar deed dit in de PlayStation 3-versie van Mass Effect 2 via een interactieve strip. Hoe dit in het derde deel gebeurt, is nog niet bekend.

Verder verandert de manier waarop computergestuurde personages omgaan met Shepard wanneer spelers geen savebestanden hebben van Mass Effect 1 en 2. Zo zullen zij niet refereren naar eerdere gebeurtenissen als spelers die niet  zelf mee hebben kunnen maken.