Het gameplay-element doet denken aan Dark Souls, waarin spelers andere spelers tegen het lijf lopen en vervolgens tegen elkaar kunnen vechten. In Deep Down vindt men echter lijken van andere spelers waar vervolgens wapens en andere items van opgepikt kunnen worden. Verder is bekendgemaakt dat spelers hun wapens en uitrusting kunnen veranderen via een techniek genaamd 'memento', al is nog niet bekend hoe dat precies werkt.

Capcom gaf ook iets meer informatie over het verhaal van de game. Deep Down speelt zich, zoals eerder aangekondigd, af in het New York van 2094. Een lid van een speciale groep genaamd de Ravens kan het verhaal dat verschillende archeologische plekken hebben 'lezen'. Een mysterieuze ondergrondse stad uit de vijftiende eeuw wordt gevonden in de Tjechische Republiek. Het hoofdpersonage van de game onderzoekt deze plek en leest de herinneringen, die de speler vervolgens meemaakt.