De game speelt zich af in de zestiende eeuw in het feodale Japan. Het land, dat ooit geregeerd werd door één heerser, is verdeeld geraakt in talloze strijdende clans. De speler kruipt in de huid van een clanleider en heeft als doel om door middel van militiaire aanvallen en diplomatiek Japan opnieuw te verenigen onder de één vlag en uitgeroepen te worden als de nieuwe Shogun, de leider van een natie waarin de vrede is hersteld.

Shogun 2: Total War biedt spelers verbeterde en volledig driedimensionale land- en zeegevechten, meldt Sega. Er is een nieuw AI-systeem dat is geïnspireerd op feodale Japanse oorlogsvoering. Ook kan de speler gebruikmaken van een tactische campagnekaart.  "Sinds de ontwikkeling van Shogun: Total War tien jaar geleden heeft het team veel nieuwe ervaring opgedaan. Het team van The Creative Assembly heeft er sindsdien altijd van gedroomd om Total War in het feodale Japan nog eens dunnetjes over te doen", aldus Mike Simpson, creative director bij de ontwikkelstudio. De meest recente titel van The Creative Assembly is Napoleon: Total War die eerder dit jaar uitkwam.