Het komt niet vaak voor dat de originele ontwikkelaar van een game toestemming geeft aan fans om een remake commercieel uit te brengen. De ontwikkelaars van Black Mesa laten in een reactie op hun forum weten vereerd en verrast te zijn. Daarnaast geeft de ontwikkelaar aan dat ervoor gekozen is om de remake commercieel uit te brengen omdat het volledige toegang nodig heeft tot de Source-engine om de game verder te verbeteren en geeft aan dat het team de financiële hulp goed kan gebruiken. Het Black Mesa-team geeft ook aan dat het project echter nooit bedoeld is als een manier om winst te maken en het daarom een moeilijke beslissing was: "Black Mesa is puur werk uit liefde."

De gratis versie blijft gewoon beschikbaar naast de nog te verschijnen betaalde versie. In de betaalde versie verschijnen onder meer extra levels die uit Black Mesa waren geschrapt door tijdsdruk. Wanneer de betaalde versie verschijnt, heeft de ontwikkelaar nog niet aangegeven.