"We willen de game ergens na de lancering gereed maken voor mods", aldus een Treyarch-medewerker op het forum van de game. "We weten nog niet in hoeverre je mods kunt aanbrengen in de game, want er zijn een aantal technische problemen gerelateerd aan de engine en een aantal aanpassingen aan de tools zullen niet makkelijk werken. [...] Op dit moment maken we echter eerst de game af." De PC-versie krijgt tevens een dev console, waarmee spelers gedurende de game middels een commandoregel aanpassingen kunnen maken op gebied van gameplay en graphics.

Eerder werd al bekend dat Black Ops op de PC dedicated servers bevat, waardoor spelers hun eigen multiplayergames op kunnen zetten. Dankzij de dedicated servers kunnen er nu ook mods, of aanpassingen, gemaakt worden voor de game. Call of Duty: Modern Warfare 2 had geen dedicated servers en modding tools op de PC, tot groot ongenoegen van de PC-achterban.