In navolging van het origineel transformeert Microsoft ook de tweede Zoo Tycoon naar de Nintendo DS. De PC-versie van de game kwam in 2004 uit en is reeds aangevuld met drie uitbreidingen (African Adventure, Endangered Species en Marine Mania).

Zoo Tycoon 2 DS wordt ontwikkeld door Altron en giet het hele dierentuingebeuren weer in een handelbaar DS-jasje. De twee bekende modes Zoo Desinger Mode en Zoo Director Mode zijn wederom van de partij, net als de nieuwe Zookeeper Mode. In deze laatste mode kun je de beesten in 3D bekijken en moet je in dit perspectief verzorgen. De game maakt gebruik van de stylus en kent een multicard optie waarin je met je vrienden dierentuinen uit kunt wisselen. Zoo Tycoon 2 DS komt begin 2008 uit.