Fallen Earth speelt  zich af in 2156, in een wereld die is geteisterd door een ernstige ziekte en waarin verschillende facties tegenover elkaar staan. De MMO verkiest een systeem gebaseerd op attributen en vaardigheden, boven het inmiddels standaard klassensysteem met levels.

Als gevolg van de ziekte zijn alle personages in het spel gemuteerd. De mutaties kunnen door spelers worden gebruikt om objecten of vijanden te vernietigen, maar ook om hun gezondheid te regenereren.