Wanneer de game nu wel uitkomt, zegt Kitabayashi niet. Naar verwachting laat de game nog wel enkele weken op zich wachten. De producer belooft dat hij en z'n team hard aan de game doorwerken om het zo goed mogelijk te maken. Kitabayashi biedt zijn excuses aan voor de vertraging.
De eShop, een virtuele winkel waarin Nintendo 3DS-bezitters games kunnen aankopen en downloaden, lanceert eind mei in Japan. Op 7 juni volgt een lancering in Europa. Mega Man Legends 3: Prototype Version is een voorproefje op Mega Man Legends 3 en biedt spelers tien mi ies en de mogelijkheid om vrij te bewegen door de wereld van de volledige game.