De zijmissie ED-E, My Love is berucht om het grote aantal technische problemen die tijdens het spelen kunnen opduiken. Wanneer spelers een savefile gebruiken van een speelsessie waarin een probleem met deze missie is voorgekomen, bestaat de mogelijkheid dat Honest Hearts niet te spelen is zonder een geheel nieuwe savegame aan te maken.

"We zijn ons bewust van de problemen en werken aan een oplossing voor een komende patch", vertelt ontwikkelaar Bethesda. "Als je al een save hebt waarin deze bug zit, zal de patch het probleem niet kunnen verhelpen en zul je terug moeten grijpen op een save van vóór ED-E om Honest Hearts te kunnen spelen."