Het betreft de Atomic Edition van de game, die naast alle originele content een bonus-episode, nieuwe wapens en vijanden bevat. Daarnaast komt de download op GoG.com met meer dan honderd gratis Duke Nukem 3D-ringtones.
In Duke Nukem 3D verdedigt de Duke de aarde tegen aliens, terwijl hij ook de tijd neemt naar strippende vrouwen te kijken en natuurlijk kauwgom te kauwen. Zijn strijd tegen de aliens brengt Duke Nukem onder andere naar Hollywood en in een UFO.