De wereld van Port Royale speelt zich af rond het jaar 1600 op de eilanden van het Caribisch gebied. Verspreid over dit domein zijn zo'n 60 steden te vinden met elk hun eigen bebouwing en specialiteiten. Eén van de doelen van Port Royale is het opbouwen van een grote handelsvloot die onderling de steden voorziet van goederen. Dat zijn natuurlijk goederen waar een schaarste in is en je de meeste winst aan zal behalen. Het ultieme doel is om gouverneur te worden.

Om het overzicht te behouden is het spel opgedeeld in 2 kaarten. De stadsplattegrond is toegankelijk voor elke locatie waar je een handelspost hebt gestationeerd of een vloot hebt liggen. In deze plattegrond bouw je niet alleen eigen gebouwen, maar maak je ook gebruik van de aanwezige instanties. Zo huur je bemanning in de lokale bar, laat je schepen repareren in de werf en koop je handelswaar op de lokale markt.

Dit handelen vormt trouwens het belangrijkste deel van de game. Zo zal je als voortvarend handelaar verschillende convooien heen en weer hebben varen en als een soort van 'privateer' je rijkdom vergroten. Ondertu en blijft het natuurlijk wel verstandig op te pa en voor piraten, die op je handelswaar belust zijn en er niet terughoudend om je van tijd tot tijd aan te vallen.