De pc-versie van Far Cry 4 crasht bij sommige gamers. Spelers krijgen een zwart scherm, wat mogelijk veroorzaakt wordt door problemen met randapparatuur, geeft Ubisoft aan. 

Op de PlayStation 3 is bij diverse spelers databeschadiging voorgevallen. De boodschap die in beeld verschijnt, "Please delete FC3 game data", suggereert dat Far Cry 3-spelers er last van ondervinden. Dit is echter niet het geval. Verder worden sommige pre-order codes niet gepakt door de console. Spelers met een pre-order ontvangingen een e-mail met daarin een code voor de 'Blood Ruby'-bonusmissie. Sommigen ontvingen deze mail niet of kregen een niet-werkende code.

Ubisoft heeft veel van de problemen al verholpen in de Day 1 Patch, al is deze niet bij iedereen gedownload. Dit geldt met name voor gebruikers die offline spelen.