In het financiële jaar 2009, dat loopt tot en met 31 maart, heeft Square Enix haar omzet zien dalen met 8% tot $1,44 miljard (ruim €1 miljard). De winst daalde in dezelfde periode met ruim 31% tot $67 miljoen (€49 miljoen). De grootste kostenpost voor de Japanse uitgever was het personeel; hier stegen de uitgaven naar $170 miljoen (€123 miljoen).
Taito, het onderdeel van Square Enix dat zich voornamelijk bezighoudt met arcadegames, boekte de hoogste omzet, maar ook grote verliezen. Het succes van offline games zorgde er echter voor dat de omzet- en kostendaling beperkt bleef.