The Lost Future is het derde deel in de puzzel- en adventureserie dat in Europa wordt uitgebracht. In het spel krijgen de professor en zijn assistent Luke te maken met een toekomstige bedreiging voor Londen. The Lost Future kent 165 nieuwe puzzels en meerdere nieuwe minigames, evenals een Super Hint-feature, die het oplossen van puzzels makkelijker kan maken voor spelers.

Professor Layton and the Lost Future heeft daarnaast meer filmpjes en legt meer de nadruk op de verhaalvertelling. Voor het spel verschijnt tenslotte ook downloadbare content via Nintendo Wi-Fi Connect.