In Pandora's Tower moeten spelers zich door ruimtes met vijanden banen. Ondertussen moeten zij ook letten op de gezondheid van het vrouwelijke personage Elena. Zij verandert langzaam in een monster en de enige manier om dit te stoppen is door haar te eten te geven.

Pandora Tower behoort samen met Xenoblade Chronicles en de Last Story tot het drietal RPG's dat Nintendo uitgeeft voor Wii in Europa. Xenoblade Chronicles verscheen vorig jaar augustus, The Last Story later deze maand op 24 februari en Pandora's Tower dus halverwege april.