In Sector 3 van Metroid: Other M zit een bug na de Desert Refinery-kamer waardoor de deur naar de volgende kamer in sommige gevallen op slot blijft zitten. Hierdoor kunnen een aantal spelers niet verder komen in de game. Nintendo Benelux geeft aan dat spelers met dit probleem een e-mail kunnen sturen naar de technische dienst van Nintendo, via td@nintendo.nl.
Hoewel Nintendo niet kan bevestigen hoe het probleem in Nederland wordt opgelost, zal dit vermoedelijk net als in het buitenland werken. Spelers moeten daar hun save file op een SD-kaart zetten, waarna het opgestuurd kan worden naar Nintendo, waar het probleem wordt verholpen.