Beide versies zijn zowel fysiek in de winkels als digitaal via de eShop te koop. Daarnaast verschijnt op 21 februari voor beide versies een gratis demo in de eShop.

De twee versies van Monster Hunder 3 Ultimate werken samen: mensen die beide versies hebben kunnen de opgeslagen gegevens van de ene versie naar de andere overzetten. Op deze manier kan de game zowel thuis op televisie als onderweg op de 3DS gespeeld worden.