Bioware zei eerder dat het door Sony kwam dat spelers van de PS3-versie de uitdagingen misliepen. Sony zou de uitdagingen voorheen niet goedgekeurd hebben, maar zegt nu "samen te werken met Electronic Arts en BioWare om de Multiplayer Challenges naar PS3 te brengen". Het is niet bekend of PS3-spelers alle Multiplayer Challenges die al geweest zijn alsnog krijgen.
De Ma Effect 3-multiplayer is een coöperatieve modus waarin vier spelers samenwerken. De Multiplayer Challenges geven spelers extra ervaringspunten en speciale uitdagingen en beloningen. Deze vinden in het weekend plaats. De laatste Multiplayer Challenge was vorig weekend.