De game combineert de RPG uit 199 met The After Years, een episodisch vervolg op Final Fantasy IV dat eerst op mobiele telefoons en later ook op WiiWare verscheen. Ontwikkelaar Square Enix verbetert de graphics van de game en voegt ook een nieuw scenario aan de game toe die Final Fantasy IV en The After Years met elkaar moet verbinden.

The After Years speelt zich zeventien jaar na het verhaal van Final Fantasy IV af en volgt de avonturen van Ceodore, de zoon van held Cecil. Final Fantasy IV Complete Edition moet in de lente van 2011 in Japan uitkomen. Een Europese release is nog niet aangekondigd.