Het is inmiddels een traditie geworden van Konami om van de games uit de MGS reeks een speciale versie uit te geven. Voor MGS3 is het al niet anders. De ontwikkelaar Kojima Productions is momenteel bezig MGS3: Subsistence te ontwikkelen; een speciale versie van MGS3 die een aantal grote veranderingen heeft ondergaan. Zo zal het mogelijk zijn om met acht spelers online tegen elkaar te spelen in verschillende gamemodes. Ook is er een nieuw camerastandpunt bijgekomen die de soms wat onhandige camera in deel 3 moet doen vergeten. Een grote toevoeging zal ook zijn de aanwezigheid van de klassieker Metal Gear 2 Solid Snake. Famitsu heeft een aantal nieuwe screens in hun blad gepubliseerd die een voorproefje tonen van wat we kunnen verwachten. Hier zijn de scans te bekijken.