In Flip's Twisted World kruip je in de huid van Flip, een tovenaarsleerling die in een kubuswereld terecht is gekomen door het verkeerde gebruik van een magisch voorwerp. Om hieruit te komen, moet Flip vijf verschillende werelden doorkruisen, op zoek naar de uitgang. Met de Wiimote kun je de omgeving draaien om zo het juiste pad te vinden.